Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 THUMPD3-201ENST00000345094 3961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TRMT10A-201ENST00000273962 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CREB3L4-201ENST00000271889 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC9A6-209ENST00000636347 4867 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091167.3-201ENST00000561573 3838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM16-201ENST00000336708 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF418-202ENST00000425570 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms