Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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E2F4Q16254 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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E2F4Q16254 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F4Q16254 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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