Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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