Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms