Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WASHC2CQ9Y4E1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms