Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms