Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms