Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms