Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms