Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NENFQ9UMX5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NENFQ9UMX5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms