Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ALKQ9UM73 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms