Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSKSQ9UJT2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSKSQ9UJT2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms