Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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