Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms