Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH3Q9UHC1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms