Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms