Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX1-2Q9UD57 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms