Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL13Q9P2N7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms