Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms