Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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