Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNK4Q9NYG8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNK4Q9NYG8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms