Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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