Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM28Q9NW13 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms