Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DCAF13Q9NV06 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DCAF13Q9NV06 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms