Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms