Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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