Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms