Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms