Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms