Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms