Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms