Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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FOXQ1Q9C009 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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