Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms