Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms