Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLVAPQ9BX97 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms