Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms