Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC32Q9BV29 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms