Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms