Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED2Q99967 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms