Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORT1Q99523 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms