Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms