Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD1Q99460 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD1Q99460 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms