Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC9Q96Q05 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms