Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC2Q96PR1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms