Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP4Q96PP9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms