Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP47Q96K76 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms