Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms