Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms