Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJA3Q96EY1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA3Q96EY1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms