Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms